由于电子制造厂、电镀厂、皮革及纺织车间林立，珠三角土壤是全国污染最严重的地区之一。专家介绍广东数十年的工业繁荣过后，砷、镉、铜和汞等制造业用重金属的扩散成为一个地区性问题，涉及很大一片区域。东莞环保介绍根据检测结果，在东莞、从化、番禺等9个蔬菜种植中心区域，大约10%至20%的蔬菜重金属含量高于国家安全标准允许的水平。一些蔬菜中还发现了铅、铬、锌和镍的踪迹。这些金属元素在人体内日积月累，会引起器官及神经损伤，甚至引发癌症。
专家表示，珠三角的佛山、东莞、惠州、中山等市工业异常发达，而超标最严重的汞元素主要来源便是工业生产，特别是由烧碱、汞化物的制作过程中大量废水污物排放造成的，这些污染物未得到有效处理即被排向河流，造成农田灌溉污染。
除了工业污染，农业生产中的面源污染也是导致土壤重金属污染的重要原因。农业生产中对氮肥和磷肥的过量使用，使土壤酸性快速上升，土壤酸化造成了重金属的活性提高。据广东省农业部门的调查显示，从1984年到现在，珠三角地区土壤的PH值下降了0.33个单位，就这个下降幅度而言，人为的因素使酸化速度比自然酸化的时间加快了将近70年。
在长三角、珠三角、西南、中南、辽中南等地区，选择被污染地块集中分布的典型区域，实施土壤污染综合治理；有关地方要在2013年年底前完成综合治理方案的编制工作并开始实施。
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